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マイページから確定申告用に作成した『医療費控除データ（XML）』は修正できますか？
確定申告(e-Tax)内で修正が可能です。
「利用する医療費通知について」で、『医療費控除データを読み込んで入力する』を選択してください。
取り込み後、次のステップに進んでいくと「⑤医療費通知データの内訳（実際に支払った医療費の入力）」がありますので、そこで修正できます。
※資料（2018年2月作成）をご参考にご確認ください。